属性ダメージはチョコワ部さんの仰る通り、スキルと属性有効度が正しく設定されていれば0ダメージになります。
ただステート有効度が0%でも、命中タイプが「必中」の場合、そのステート有効度が無効になります。
例えばステート有効度・戦闘不能0%のキャラに対しても、命中タイプ「必中」でステート付加・戦闘不能100%のスキルを当てれば
ステート有効度0%という耐性を貫通して戦闘不能にできます。(「ステート無効」の場合はそれでも効かないが、それだと今度は
絶対に戦闘不能にならない無敵キャラになってしまうので注意が必要です)。
きっちりダメージで倒し切る仕様にするか、命中タイプを「必中」以外にすることで解決すると思います。
追伸:書き込み中に解決していたようで何よりです。